そんなにフレーム単位で編集したいならGOB単位1でmpegムービー作ればいいんだよ。
データが無駄になるけど出来るよ。

そのかわり、多くのDVDプレーヤで再生は出来るが、速見などでギクシャクする場合がある。特に2倍速が変になる。