瀧が酒を飲んだあと、山頂で三葉と奇跡の再会は果たすのだけど、
瀧が入れ替わったのは「彗星が落下する前の三葉」だよね。

なら、山頂で奇跡の再会を果たした「1度死んだ三葉」はどっからきたの?

(瀧が入れ替わった)彗星落下を経験してない三葉(彗星落下は目撃してない)
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山頂へ行く
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「わたし、あの時死んだの?」←彗星落下を目撃した三葉(時間軸的に存在不可能)