オリジナルのGSの孵化とその元となった魔法少女の魔女化が一致しない事が発生し得るパターンとしては
魔女倒して得たGSを最終的にキュゥべえに処理させずに再び呪いを集めさせて孵化させるパターンがとりあえずは挙げられるねぇ