12話でQBはこう言っている
「まあ確かに、浄化しきれなくなったソウルジェムが、何故消滅してしまうのか――その原理は僕たちでも解明できてない」

現実主義のQBが自分達が作り出した魔法少女システムにおいて唯一、SG消滅の原理を
解らないまま放置するとは思えないし、「解明できてない」と言っていることから何らかの
調査なり研究なりをしていたのは確かだろうね