オカリン消失周りについて自分なりに解釈してみたんだが
ＳＧに存在しているオカリン→ＲＳの負荷(暴走）→今いる世界線での存在が確定できなくなる

＝オカリンが存在する世界線、オカリンが存在しない世界線、の２つの可能性世界線に分岐する

物語中盤ではＲＳの周期的な暴走（？）によりこの２つの可能性世界線が細かくＯＮ、ＯＦＦを繰り返す。（助手が見た、消えたり現れたりするオカリン）
助手はオカリンほど強いＲＳを持っているわけではないので世界線の変動を感知できずその為オカリンが突然消えたように映る

また、オカリンが消える（存在しなくなる）理由については、オカリンが存在しなくなることだけが確定されている訳でその理由はなんでもいい
（まゆりの死と同じ）

こんな感じなら分岐（ゆらぎ）始めたのが最近なのでショタリンの存在も説明できるし自分の中ではすとんと来たんだがどうだろうか・・・
鈴羽がどんな説明してたかもはや頭に残ってないからただの妄想垂れ流しかもしれん・・・すまん