もしもボックスはパラレルワールドにする、のではなく
パラレルワールドを作り出してその中に使用者が入り込む道具。

通常世界ののび太が1年生の魔法を使えないことを「一応」驚かれているところをみると、魔法世界ののび太も人並みにはできるがそれなりに落ちこぼれのようだ。
おそらくご都合主義的に魔法世界ののび太は家出でもしてるんでしょう。