コスモナウトでは貴樹は明里との関係は終わってしまった（あるいは終わらせてしまった）ってわかっていたんだと思うよ。
でもあきらめきれないから貴樹は明里の幻影を見ているんだと思うよ。
幻影を追い求めるのはもう手が届かないと思っているからだからね。
連絡が途絶えた原因は描かれていないけど、どちらから連絡が無くなったかは断定出来ないと思うよ。