亀ですまん。
甲板周りの空気についての個人的解釈。

永久にの古代とサーシャのシーンは，甲板上は空気の層があるってことでOK。
新たなる旅立ちのラストの古代とデスラーのシーンは，
並んでいる艦どうしとはいえそこそこ距離はあるだろうし，
途中はさすがに真空のはずなので，古代のメットに通信用のマイクが付いてるってことで。
デスラー戦闘空母は甲板上に集音マイクやスピーカーがあるのでは・・・？w

まぁ妄想ですが・・・。w