これは俺が複数の関係者に聞いた範囲での不確定情報だから、話半分で聞いていいけど、
松本関連のヤマト作品企画は複数あって製作会社もそれぞれバラバラ。
一つはバンダイ主導
ゲームでこれはＰから任天堂ｗソフト移植の旧作題材
そっからグレートに繋げるのだけどそれはゲームじゃない（それがTV企画？？)
二つ目は某ウルトラマン系製作会社が絡む
ヤマトの姉妹艦まほろばの話で、これがОＶＡや、衛星放送やネット配信系。
三つめが例のサンキョーの大ヤマトゼロ
マクロスＦやアクエリオン、ハフナーなんかのサテライトが製作のパチ映像なんだけど
これがなんと作中途中から偽装を解いてまほろばになっちゃう
(つまり大ヤマトは時空を超えた別時空でグレートヤマトの姉妹艦まほろばが、
任務を果たしていた話だったってオチ)

それで複数の会社で製作されてるヤマト作品が、それぞれ密接にリンクしてるってのが味噌で
やがて一つになるってのが、松本の方のカラー。

松本版旧作題材(ゲーム)＝グレートヤマト(TV？劇場？)
時空戦艦マホロバ(OVA企画))＝大ヤマトゼロ(パチ)
それでグレートとマホロバは姉妹艦ってリンクな図式ってこと。