やっぱりさー
主人公が、いったい何をしたいのが分からない、ってのが問題なんじゃない?

例えば…
レイのお父さんを縁もゆかりもない悪のマッド・サイエンティストにしてさ
おじいちゃんが、善の科学者ね
で、レイはおじいちゃんのアドバイスを受けつつ成長する、と
(まあお父さんは事故で死んじゃったことにすればいいよ)

そうすれば、物語も整理できるし、キャラにも感情移入できたんじゃないかなぁ

良い人も悪い面を持っているってのがスチームボーイ
今まで良い人だと思っていたスチーブンソンの弟子みたいな人が、スチームボール渡せって言うみたいなとこね
結局、良い人がいない

その辺が敗因かな、と
長くてゴメン