>>713
Odinを使ってパーティションテーブルを変更する場合
・「Re-Partion」のチェックをつける
・PITに適当なファイルを指定
・PDAに >>694 のファクトリーイメージ
ここで一度Androidを再起動

再度、Odinで「Re-Partition」のチェックを"はずして"
PDAにCWMイメージを指定して書き込む
　JBならGT-I9100_JB_ClockworkMod-Recovery_6.0.2.9.tar
　KKならCWM-KitKatCompatible-i9100_6.0.4.5.tar ←の方がトラブルは少なそう…

Recovery Modeにして
CWM→Mounts and Storage→ Format /system、Format /cache、Format /data、Format /storage/sdcard0 を実行
ここからお好みのROMを焼くという手順です

たぶんフォーマットのし忘れか、KitKat用CWMの導入で直りそうな気もします…
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STOCKの状態に戻すには

Odinの「Re-Partition」にチェック
PITにI9100_2GB-STOCK.pitを指定
PDAに >>694 のファクトリーイメージを指定

で復旧すると思います
(/storage/sdcard0のフォーマットとWipe data/factory resetは必要かも…)