Android4.2なんですが、フォルダの階層がすさまじいことになってしまっています。

storage/emulated/0/0/0/0
くらいになってしまいました。
ファクトリーリセットかけるほかきれいにする方法はないのでしょうか。

cwmでwipeするたびにおこってしまっているようです。